Cục Thuế ban hành hướng dẫn hỗ trợ doanh nghiệp phục hồi sau bão lũ

Công văn được ban hành trên cơ sở Kết luận của Thường trực Chính phủ tại Thông báo số 533/TB-VPCP ngày 4/10/2025 về tình hình và giải pháp khắc phục hậu quả bão lũ. Theo đó, Cục Thuế yêu cầu các địa phương khẩn trương triển khai hướng dẫn người nộp thuế thực hiện các chính sách miễn, giảm, gia hạn và khoanh nợ thuế theo quy định pháp luật, đồng thời phối hợp với chính quyền, cơ quan tài chính, bảo hiểm và các tổ chức liên quan để xác minh mức độ thiệt hại, làm căn cứ áp dụng các biện pháp hỗ trợ.

Một trong những nội dung quan trọng của hướng dẫn là việc áp dụng chính sách miễn, giảm thuế sử dụng đất phi nông nghiệp cho tổ chức, cá nhân, doanh nghiệp bị thiệt hại nặng do thiên tai. Cụ thể, các đơn vị có mức thiệt hại từ 20% đến dưới 50% được giảm 50% số thuế phải nộp; trường hợp thiệt hại từ 50% trở lên được miễn toàn bộ thuế trong năm xảy ra sự cố. Đây là giải pháp thiết thực nhằm giảm gánh nặng tài chính cho các cơ sở sản xuất, đặc biệt là doanh nghiệp nông nghiệp, chế biến nông sản và làng nghề vốn chịu tổn thất nặng nề về cơ sở hạ tầng, kho bãi, nhà xưởng.

Đối với người thuê đất để sản xuất nông, lâm, ngư nghiệp hoặc làm muối, công văn hướng dẫn rõ việc miễn hoặc giảm tiền thuê đất tương ứng với tỷ lệ thiệt hại thực tế. Nếu tỷ lệ thiệt hại dưới 40%, doanh nghiệp được giảm theo mức tương ứng; trường hợp thiệt hại từ 40% trở lên sẽ được miễn toàn bộ tiền thuê đất trong năm bị thiên tai, với điều kiện đã hoạt động ít nhất 3 năm và có xác nhận của cơ quan thuế, tài chính cùng chính quyền địa phương. Chính sách này không chỉ giúp doanh nghiệp nông nghiệp giảm chi phí cố định mà còn tạo điều kiện để họ nhanh chóng khôi phục hoạt động sản xuất, ổn định việc làm cho người lao động.

Với các doanh nghiệp sản xuất hàng hóa chịu thuế tiêu thụ đặc biệt bị ảnh hưởng bởi bão, mưa lũ, công văn cho phép giảm tối đa 30% số thuế phải nộp trong năm xảy ra thiệt hại, căn cứ trên tổn thất thực tế nhưng không vượt quá giá trị tài sản bị hư hại sau khi trừ phần bảo hiểm bồi thường. Cùng với đó, các khoản chi phí sửa chữa, khắc phục hậu quả, tổn thất về tài sản, nguyên vật liệu hoặc hàng hóa bị hư hỏng do thiên tai đều được tính vào chi phí được trừ khi xác định thu nhập chịu thuế, giúp doanh nghiệp không phải nộp thuế trên phần thiệt hại thực tế chưa được bù đắp.

Song song với các chính sách miễn, giảm thuế, Cục Thuế còn yêu cầu các địa phương xem xét gia hạn thời hạn nộp thuế đối với những doanh nghiệp, hộ sản xuất và cá nhân gặp khó khăn do bão lũ. Việc gia hạn này được thực hiện trên cơ sở hồ sơ thực tế và mức độ thiệt hại, không tính tiền chậm nộp trong thời gian được gia hạn. Những trường hợp bị mất hồ sơ, ngừng hoạt động hoặc gián đoạn sản xuất vì ngập lụt sẽ được chấp thuận kéo dài thời hạn kê khai, nộp tờ khai và quyết toán thuế đến khi khắc phục xong hậu quả.

Một điểm đáng chú ý khác là quy định miễn tiền chậm nộp và miễn xử phạt hành chính đối với người nộp thuế chịu ảnh hưởng trực tiếp của thiên tai. Cơ quan thuế địa phương được quyền xác nhận tình trạng bất khả kháng để không tính tiền chậm nộp trong thời gian sản xuất bị đình trệ. Trường hợp người nộp thuế chậm kê khai hoặc sai sót do mất dữ liệu, mất chứng từ vì thiên tai cũng sẽ được xem xét miễn xử phạt, bảo đảm tinh thần hỗ trợ tối đa để doanh nghiệp sớm trở lại hoạt động bình thường.

Đối với doanh nghiệp có hàng hóa, tài sản bị hư hỏng, công văn hướng dẫn tiếp tục cho phép khấu trừ thuế giá trị gia tăng nếu có hóa đơn, chứng từ hợp lệ kèm biên bản xác nhận thiệt hại của cơ quan có thẩm quyền. Trong trường hợp hàng hóa phải tiêu hủy, doanh nghiệp chỉ cần lập biên bản tiêu hủy có sự chứng kiến của cơ quan thuế, tài chính và quản lý thị trường, không phải chờ giám định, qua đó rút ngắn thời gian xử lý và bảo đảm minh bạch.

Để tạo thuận lợi trong việc thực hiện các chính sách này, Cục Thuế yêu cầu các địa phương phân công cán bộ đầu mối hỗ trợ trực tiếp người nộp thuế, hướng dẫn hoàn thiện hồ sơ, khôi phục dữ liệu kế toán – thuế bị mất và xác định giá trị thiệt hại đúng quy định. Trường hợp hồ sơ, chứng từ giấy bị hư hại do bão lũ, người nộp thuế được phép sử dụng bản sao điện tử thay thế và khai bổ sung khi có điều kiện.